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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730
EISSN: 1021-9730
Vol. 21, No. 2, 2013, pp. 109-117
Bioline Code: cs13011
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge

African Crop Science Journal, Vol. 21, No. 2, 2013, pp. 109-117

 fr
BEGUM, H.; REDDY, M.T.; MALATHI, S.; REDDY, B.P.; NARSHIMULU, G.; NAGARAJU, J. & SIDDIQ, E.A.

Résumé

‘Chinnarasam’, un cultivar juteux du manguier ( Mangifera indica check for this species in other resources L.), est parmi les manguiers d’un Etat indien d’Andhra Pradesh, dont la production et la qualité sont variables à travers la région. Vingt nouvelles accessions de ‘Chinnarasam’ (CR Acc-l à CR Acc-20) étaient sélectionnées parmi 9 lieux de propagation sur 6 districts représentant toutes les trois régions eco-géographiques d’Andhra Pradesh (la partie cotière d’ Andhra, Rayalaseema et Telangana). Leurs feuilles étaient échantillonnées pour étudier la diversité intracultivar suivant l’analyse microsatellite. Le dendrogramme généré sur base de la moyenne du groupe paire non pondérée avec la moyenne arithmétique a montré trois groupes importants d’ accessions en rapport avec la séparation géographique. Vingt sur 109 microsatellites spécifiques de manguiers validés étaient polymorphes (18.34 %). Les microsatellites ont produit un total de 62 allèles parmi lesquelles 31 étaient polymorphes (50 %). Le coefficient de similarité de Jaccard variait de 0.54 à 1.00. L’existence de diversité génétique intracultivar (jusqu’à 46 %) indique que le ‘Chinnarasam’ cultivé à travers l’ Etat n’est pas un clone pur, ce qui permet l’amélioration génétique de ce cultivar par le moyen de la sélection massive. Les marqueurs microsatellites se sont avérés utiles dans l’évaluation de la diversité génétique intracultivar et l’identification des accessions du cultivar ‘Chinnarasam’.

Mots Clés
Enquête éco-géographique, diversité génétique, rapport génétique, marqueurs SSR

 
 en MICROSATELLITE ANALYSIS OF INTRA CULTIVAR DIVERSITY IN ‘CHINNARASAM’ MANGO FROM ANDHRA PRADESH, INDIA
BEGUM, H.; REDDY, M.T.; MALATHI, S.; REDDY, B.P.; NARSHIMULU, G.; NAGARAJU, J. & SIDDIQ, E.A.

Abstract

‘Chinnarasam’, a juicy cultivar of mango ( Mangifera indica check for this species in other resources L.), is among the most important mangoes of an Indian State of Andhra Pradesh, whose production and quality is variable across the State. Twenty accessions of ‘Chinnarasam’ (CR Acc-l to CR Acc-20) were selected from 9 locations spread over 6 districts, representing all the three eco-geographical regions (Coastal Andhra, Rayalaseema and Telangana) of Andhra Pradesh. Their leaves were sampled to study intracultivar diversity following microsatellite analysis. The dendrogram generated based on unweighted pair group mean with arithmetic average, showed three major groups of accessions, which followed geographical separation. Twenty out of 109 mango-specific microsatellites validated, were polymorphic (18.34%). Microsatellites produced a total of 62 alleles, of which 31 were polymorphic (50%). The Jaccard’s similarity coefficient ranged from 0.54 to 1.00. Existence of intracultivar genetic diversity (up to 46%) indicates that ‘Chinnarasam’ whatsoever cultivated throughout the State is not a pure clone, which allows the genetic breeding of this cultivar by means of mass selection. Microsatellite markers have proven useful in assessing intracultivar genetic diversity and identifying accessions of ‘Chinnarasam’ cultivar.

Keywords
Eco-geographic survey, genetic diversity, genetic relationship, SSR markers

 
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