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SIMPLE SEQUENCE REPEAT MARKERS ASSOCIATED WITH ANTHRACNOSE AND Turcicum LEAF BLIGHT RESISTANCE IN SORGHUM BESHIR, M.M.; ALI, A.M.; RUBAIHAYO, P.; AHMED, N.E. & OKORI, P. Abstract Deployment of host resistance remains the most cost effective strategy for management of foliar and grain diseases, especially for resource constrained farmers. There is paucity of information on dual resistance in sorghum to both diseases. The objective of this study was to identify SSR markers associated with anthracnose and TLB resistance in sorghum for future use in markers assisted introgression. Mapping of resistance to anthracnose and Turcicum leaf blight (TLB) was undertaken in 126 F8:9 sorghum recombinant inbred lines, derived from a cross between MUC007/009 and Epuripuri. The F8:9 RILs were evaluated for field resistance to anthracnose and TLB in Uganda and Sudan. There were significant differences among locations (P<0.001), suggesting a strong influence of environments on reaction to both diseases. Transgressive segregation was observed, indicating that both parents carried minor loci or alleles for resistance that differed from each other. SSRs Xtxp25, Xtxp201, Xtxp302, Xtxp25, Xtxp295 and Xtxp95 were associated, respectively, with anthracnose and TLB resistance, consistent with dominant epistasis gene action. The SSRs Xtxp201 and Xtxp303 were associated with both anthracnose and TLB resistance. High polymorphic information content (0.44 to 0.59) and gene diversity (0.54 to 0.66) were observed. SSRs could be used to detect the dual resistant genotypes and, therefore, contribute substantive information to multiple disease resistance research of sorghum. Keywords Dual resistance; simple sequence repeats

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BESHIR, M.M.; ALI, A.M.; RUBAIHAYO, P.; AHMED, N.E. & OKORI, P. Résumé Le développement d’hôtes résistantes demeure la plus efficace des stratégies de lutte contre les maladies foliaires et de grains, surtout en direction de petits producteurs à ressources limitées. There is paucity of information on dual resistance in sorghum to both diseases. L’objectif de cette étude était d’identifier des marqueurs SSR associés à la résistance du sorgho à l’anthracnose et la maladie de brulure foliare causée par le Turcicum, dans une perspective d’introgression de gènes assistée par des marqueurs. La cartographie des genes associées à ces maladies a été entreprise avec une population de 126 F8:9 lignées de sorgho (RILs), obtenues d’un croisement entre derived MUC007/009 et Epuripuri. Les lignées F8:9 ont été évaluées en Ouganda et au Soudan pour leur résistance à à l’anthracnose et la maladie de brulure foliare causée par le Turcicum. Des différences significatives (P<0.001) ont été observées entre les locations. Ceci montre que les facteurs environnementaux ont une influence majeure dans la résistance à ces deux maladies. Une ségrégation transgressive a été observée, indiquant que les deux parents sont porteurs de différents loci mineurs ou allèles de résistance. SSRs Xtxp25, Xtxp201, Xtxp302, Xtxp25, Xtxp295 et Xtxp95 étaient respectivement associés à la résistance à l’anthracnose et à la maladie de brulure foliare causée par le Turcicum, et ceci de façon consistante avec un effet épistatique des gènes. Les SSRs Xtxp201 et Xtxp303 étaient associés à la résistance aux deux maladies. Une part élevée de polymorphisme (0.44 to 0.59), et de diversité de gène (0.54 to 0.66) ont été observée. Les marqueurs SSRs pourront donc être utilisés pour détecter des génotypes à double résistance, et par conséquent, contribuer pour une grande part dans la recherche de résistance multiple chez le sorgho. Mots Clés Double résistance; répétitions de séquences simples

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