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African Crop Science Journal
African Crop Science Society
ISSN: 1021-9730 EISSN: 1021-9730
Vol. 29, No. 4, 2021, pp. 459-470
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Bioline Code: cs21029
Full paper language: English
Document type: Research Article
Document available free of charge
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African Crop Science Journal, Vol. 29, No. 4, 2021, pp. 459-470
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Zananirina, A.J.; Iacomi, B.M.; Rakoto-Ranoromalala, D.A.D.; Ratsizafy, I.; Razakatiana, A.T.E.; Andrianandrasana, M.D.; Baohanta, R.H.; Rakotoarimanga, N.; Randriambanona, H. & Ramanankierana, H.
Résumé
Les Mascarocoffea sont des caféiers sauvages endémiques de Madagascar. Ces plantes produisent des biomolécules diversifiées, souvent spécifiques et inexistantes chez les caféiers cultivés. La production de ces composés pourrait être due aux interactions des microorganismes endophytes et la plante hôte. Peu d’étude a été réalisée sur la richesse et la diversité des microorganismes associés à ces caféiers. L’objectif de cette étude est d’identifier les champignons endophytes isolés à partir des feuilles de quatre espèces de Mascarocoffea par la méthode morphologique et moléculaire. Quinze taxons ont pu être identifiés morphologiquement parmi les 30 isolés. Ce sont : Phyllosticta
sp., Colletotrichum
sp., Daldinia
sp., Diaporthe
sp., Cladosporium
sp., Fusarium
sp.01, Fusarium sp.02, Fusarium sp. 03, Monilinia
sp., Trichoderma
sp., Alternaria
sp., Penicillium
sp., Aspergillus niger
, Rhizopus
sp. et Nigrospora
sp. Le phylum des Ascomycota est le mieux représenté avec 14 taxons et 1 taxon (Rhizopus sp.) appartient au phylum de Zygomycota. La caractérisation moléculaire a permis de confirmer l’identité de ces 15 taxons et celles des mycotaxons morphologiquement Non Identifiées (NI) dont Colletotrichum karstii
, Colletotrichum siamense
, Neofusicoccum parvum
, Colletotrichum siamense, Punctularia strigosozonata
, Stemphylium solani
, Phoma multirostrata
, Calophoma complonata, Daldinia vanderguchtiae
, Phoma exigua
et Boremia exigua
. Cette étude nous a permis d’identifier les champignons endophytes des feuilles de Mascarocoffea de Madagascar.
Mots Clés
Diversité; champignons endophytes; Madagascar; Mascarocoffea
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en |
Endophytic fungi associated with four endemic wild coffee species (Mascarocoffea) in Madagascar
Zananirina, A.J.; Iacomi, B.M.; Rakoto-Ranoromalala, D.A.D.; Ratsizafy, I.; Razakatiana, A.T.E.; Andrianandrasana, M.D.; Baohanta, R.H.; Rakotoarimanga, N.; Randriambanona, H. & Ramanankierana, H.
Abstract
Mascarocoffea are wild coffee plants endemic to Madagascar. These plants produce diverse, often specific biomolecules that are not found in cultivated coffee plants. Production of these compounds could be due to interactions between the endophytes and the host plant. Few studies have been carried out on the richness and diversity of microorganisms associated with these coffee plants. The objective of this study was to identify endophytic fungi isolated from the leaves of species of Mascarocoffea by morphological and molecular methods. Fifteen taxa were morphologically identified among the 30 isolated. These included Phyllosticta
sp., Colletotrichum
sp., Daldinia
sp., Diaporthe
sp., Cladosporium
sp., Fusarium
sp.01, Fusarium sp. 02, Fusarium sp. 03, Monilinia
sp., Trichoderma
sp., Alternaria
sp, Penicillium
sp., Aspergillus niger
, Rhizopus
sp. and Nigrospora
sp. The phylum Ascomycota was the most represented, with 14 taxa and 1 taxon (Rhizopus sp.) belonging to the phylum of Zygomycota. Molecular characterisation confirmed of the identity of these 15 taxa and those of the morphologically Unidentified (NI) mycotaxa including Colletotrichum karstii
, Colletotrichum siamense
, Neofusicoccum parvum
, Colletotrichum siamense, Punctularia strigosozonata
, Stemphylium solani
, Phoma multirostrata
, Calophoma complonata, Daldinia vanderguchtiae
, Phoma exigua
and Boremia exigua
. This study allowed us to identify the endophytic fungi isolated from Mascarocoffea leaves from Madagascar.
Keywords
Diversity; endophytic fungi; Madagascar; Mascarocoffea
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